在标准物质保存中，部分使用者存在一个错误的认识，认为温度越低越好，所有标准物质都放到冰箱冷藏甚至冷冻，然而事实并非如此，这样做确实能够保证组分不分解，但低温使得化合物的溶解度降低，因而导致常温下就难溶解的化合物在低温下长时间放置时析出晶体，而且一旦析出晶体很难再溶解，例如十氯联苯、乙体六六六和十溴二苯醚，如以异辛烷做溶剂，标准物质的浓度在10μg/mL时，如放在冰箱冷藏，就会析出晶体。
因此，标准物质应严格按照证书要求保存，标准物质的保存条件是在稳定性研究中确定的，而标准物质的使用条件，如温度、配制方法、干燥方法、水分校正方法、混匀方法等，则是标准物质定值过程严格确定和遵守的，不按照规定使用和保存会导致标准物质的量值不再有效，测量结果与标准值相比较出现偏差。
