MSK-IMPACT™是一个更加灵活、全面的癌症基因检测平台，由MSK病理科开发。它基于二代测序技术，能够一次对病人肿瘤468个基因的基因突变及遗传变异进行快速、灵敏的检测，可对患者这些基因上所有的重要区域进行测序，并能够检测到基因上所有蛋白编码区突变、拷贝数变化(CNAs)、启动子突变和基因组重排。目前，常规针对癌症的基因检测只针对少数几种癌症或只针对几个基因和突变位点，相比之下，MSK-IMPACT™适用于任何肿瘤类型，可一次性了解几百个基因的全面信息，并能够检测到罕见的突变以及其他关键的遗传变异。毫无疑问，这种检测将成为未来肿瘤精准治疗的一个重要组成部分，可灵活、全面地鉴定治疗中可靶向的基因并了解癌症进展。
从2014年1月起，MSK-IMPACT™便被用于分析MSK的晚期癌症患者。最初，它涵盖了341个癌症相关基因。而现在，它可以一次性检测468个基因的改变。遗传学家和病理学家Michael Berger为MSK-IMPACT™的主要开发者，他在获批后表示：“FDA的评审专家认为，MSK-IMPACT™几乎是目前最好的基因组检测平台。他们还选择与我们合作，以确定在将来如何评估这种类型的检测。MSK-IMPACT™的获批为这类检测的学术研究和商业开发创下了先例。”
遗传学家Michael Berger为MSK-IMPACT™的主要开发者
研究人员表示，开发MSK-IMPACT™是一项艰巨的工作，由许多不同背景人员合力完成，FDA的审批无疑是建立在MSK丰富的创新历史和大规模的临床研究基础上。据悉，MSK-IMPACT™检测项目由MSK分子诊断服务部门负责，并由医学科学家Marc Ladanyi所领导，已逐渐成为MSK的常规护理项目。迄今为止，超过2万名MSK晚期癌症患者已经通过这一检测平台对肿瘤进行了测序。由此产生的数据除了用于指导病人的治疗，同时也提供了大量宝贵的信息，推动了更深入的实验研究。
基因测序指导癌症治疗
MSK病理学系主任David Klimstra说道：“虽然病理学几乎可以指导癌症治疗过程中的每个决策，但MSK-IMPACT™使病理学家可以更好地了解每个病人疾病发生的遗传学基础。通过测序获得的有价值数据可以指导治疗决策，并且在某些情况下，可以帮助选择癌症临床试验的受试者。”
根据今年五月《自然·医学》期刊发表的一项研究，100多位MSK的研究人员利用MSK-IMPACT™对10336例患者进行了基因测序，其中近37%的患者都有至少一种可用MSK-IMPACT™检测到的突变，这意味着他们可以参与一些靶向药物的临床试验。根据这些检测结果，该研究报道，11%的患者(约1000人)能够直接参与MSK不同靶向药物的临床试验。
基于该检测结果，研究人员除了确定了可以进行不同靶向治疗的患者之外，还发现了患者表现出的基因突变情况，包括微卫星不稳定性(MSI)，这表明某些患者更可能会对免疫治疗产生反应。今年5月，美国FDA批准了PD-1抗体Keytruda 用于治疗携带微卫星不稳定性高(MSI-H)或错配修复缺陷(dMMR)的成人和儿童实体瘤患者。这也是美国FDA批准的首款不依据肿瘤来源，而是依据生物标志物进行区分的抗肿瘤疗法。FDA本次对MSK-IMPACT™授权的一个应用方面便是MSI检测，这无疑为该检测平台增加了额外的意义。
所有检测数据都将得到共享
此外，所有通过MSK-IMPACT™测试收集的数据都将通过MSK开发的数据库cBioPortal(http://cbioportal.org/msk-impact)提供给科学界。在这些数据中，患者的个人识别信息将被删除，保留基本的临床数据，使研究人员能够充分研究特定基因组改变与患者治疗反应及其最终结果之间的联系。
于此同时，来自MSK-IMPACT™检测平台的数据也将通过AACR GENIE项目得到共享。AACR GENIE项目是一个长期的国际性多阶段数据共享项目，于2015年11月由AACR牵头，携手八个全球领先的癌症中心，旨在利用肿瘤的基因组测序推进癌症精准医疗，MSK为该项目贡献了最多的病人数据。
编辑点评
NGS已经成为了一种趋势，它给现行的伴随诊断（CDx）的监管模式带来了一些挑战。到目前为止，FDA仅仅批准了用于单一分析物或标志物的伴随诊断，并表示这些诊断只能伴随单一药物使用（one-drug-one-test）。但是越来越多实验室开始开发和使用NGS panel，这种panel可以同时检测大量基因，为癌症患者制定个性化的治疗方案。制药公司已经意识到one-durg-one-test的伴随诊断模式是不合理的，并开始研发NGS panels，从多种药物中确定患者响应最佳的药物。一些制药公司已经签署了协议，开发所谓的通用型伴随诊断，这种诊断也将使用到NGS。FDA从支持更广泛的肿瘤panel的分析验证角度，考虑如何评估实验室检测变异的能力。
(原标题：FDA给力！首个NGS癌症大panel基因检测获批)
